| Município | Prováveis casos* | População | Coef. Ind. | ||
| 1 | Além Paraíba | 418 | 35720 | 1170,21 | Alta |
| 2 | Argirita | 10 | 2890 | 346,02 | Alta |
| 3 | Astolfo Dutra | 142 | 13937 | 1018,87 | Alta |
| 4 | Cataguases | 218 | 74171 | 293,92 | Média |
| 5 | Dona Euzébia | 18 | 6435 | 279,72 | Média |
| 6 | Estrela Dalva | 3 | 2471 | 121,41 | Média |
| 7 | Itamarati de Minas | 4 | 4318 | 92,64 | Baixa |
| 8 | Laranjal | 1 | 6799 | 14,71 | Baixa |
| 9 | Leopoldina | 33 | 53145 | 62,09 | Baixa |
| 10 | Palma | 0 | 6746 | 0 | Silencioso |
| 11 | Pirapetinga | 46 | 10818 | 425,22 | Alta |
| 12 | Recreio | 61 | 10667 | 571,86 | Alta |
| 13 | Santana de Cataguases | 0 | 3836 | 0 | Silencioso |
| 14 | Santo Antônio do Aventureiro | 19 | 3659 | 519,27 | Alta |
| 15 | Volta Grande | 39 | 5288 | 737,52 | Alta |
| REGIONAL | Nº MUNICIPIOS | POPULAÇÃO | CASOS PROVÁVEIS 2016 | |
| 1 | Alfenas | 26 | 483.888 | 342 |
| 2 | Barbacena | 31 | 522.283 | 30 |
| 3 | Belo Horizonte | 39 | 5.414.392 | 7.527 |
| 4 | Coronel Fabriciano | 35 | 833.733 | 1.467 |
| 5 | Diamantina | 33 | 427.631 | 45 |
| 6 | Divinópolis | 54 | 1.266.025 | 1.744 |
| 7 | Governador Valadares | 51 | 696.280 | 153 |
| 8 | Itabira | 25 | 451.254 | 111 |
| 9 | Ituiutaba | 9 | 194.442 | 333 |
| 10 | Januária | 26 | 421.973 | 88 |
| 11 | Juiz de Fora | 37 | 805.722 | 87 |
| 12 | Leopoldina | 15 | 240.900 | 958 |
| 13 | Manhumirim | 34 | 472.054 | 296 |
| 14 | Montes Claros | 53 | 1.102.173 | 539 |
Distribuição dos casos notificados de microcefalia por UF, até 23 de janeiro de 2016
Fonte: Ministério da Saúde
| Regiões e Unidades Federadas | Casos de Microcefalia e/ou malformações, sugestivos de infecção congênita | Total acumulado de casos notificados de 2015 a 2016 | ||
| Em investigação | Confirmados | Descartados | ||
| Brasil | 3.448 | 270 | 462 | 4.180 |
| Alagoas | 158 | 0 | 0 | 158 |
| Bahia | 471 | 35 | 27 | 533 |
| Ceará | 218 | 4 | 7 | 229 |
| Maranhão | 119 | 0 | 15 | 134 |
| Paraíba | 497 | 31 | 181 | 709 |
| Pernambuco | 1.125 | 138 | 110 | 1.373 |
| Piauí | 91 | 0 | 0 | 91 |
| Rio Grande do Norte | 133 | 60 | 15 | 208 |
| Sergipe | 172 | 0 | 0 | 172 |
| Região Nordeste | 2.984 | 268 | 355 | 3.607 |
| Espírito santo | 52 | 0 | 0 | 52 |
| Minas Gerais | 8 | 1 | 39 | 48 |
| Rio de Janeiro | 122 | 0 | 0 | 122 |
| São Paulo | 18 | 0 | 0 | 18 |
| Região Sudeste | 200 | 1 | 39 | 240 |
| Acre | Sem registro | Sem registro | Sem registro | Sem registro |
| Amapá | Sem registro | Sem registro | Sem registro | Sem registro |
| Amazonas | Sem registro | Sem registro | Sem registro | Sem registro |
| Pará | 6 | 0 | 0 | 6 |
| Rondônia | 1 | 0 | 0 | 1 |
| Roraima | 5 | 0 | 0 | 5 |
| Tocantins | 70 | 0 | 12 | 82 |
| Região Norte | 82 | 0 | 12 | 94 |
| Distrito Federal | 5 | 0 | 9 | 14 |
| Goiás | 62 | 0 | 0 | 62 |
| Mato grosso | 110 | 0 | 37 | 147 |
| Mato Grosso do Sul | 3 | 0 | 1 | 4 |
| Região Centro-Oeste | 180 | 0 | 47 | 227 |
| Paraná | 2 | 0 | 8 | 10 |
| Santa Catarina | 0 | 0 | 1 | 1 |
| Rio Grande do Sul | 0 | 1 | 0 | 1 |
| Região Sul | 2 | 1 | 9 | 12 |